橘小实蝇是一种绿豆大小的农业害虫。别看它是个小不点，却堪称“果蔬杀手”，由于其生计、繁衍力强，若何防治一直是个不毛。近日，中国农业科学院深圳农业基因组计划所（岭南当代农业科学与技巧广东省履行室深圳分中心）王桂荣课题组聚拢崔鹏课题组，顺利构建了迄今闭幕最完整的橘小实蝇基因组图谱，为科学家研发基于基因组妙技的绿色防控技巧提供了新想路，也知道小虫豸粗略迈入端粒到端粒的基因组期间。联系论文日前发表于海外学术期刊《当然·通信》。
中国农业科学院深圳农业基因组计划所计划员王桂荣先容，与传统农药比拟，针对害虫的绿色防控技巧具有更大上风，而破译害虫的基因密码则是顺利的关节场所。高质地的基因组图谱如吞并张舆图，不错为修复新的绿色防治妙技、靶宗旨精确发现与定位提供关节带领。
但想“看清”橘小实蝇的基因组可不是一件容易的事。“这种害虫的体长仅有8毫米，是典型的小个体农业害虫，这使得咱们从单个橘小实蝇中仅能索取1微克DNA含量，无法达到‘传统测序建库至少需要5微克DNA’的条件。另一方面，橘小实蝇的基因组高度复杂，也成为绘图高质地图谱的难点。”王桂荣说。
守望情况下，图谱上从染色体一端的端粒到另一端的端粒应该贯穿完整。由此，计划团队提议一种新的拼装政策——以单个体雄虫的测序数据行为基本骨架，整合群体测序数据，哄骗不同的测序技巧相互补充，最终顺利拼装出中心粒和端粒区域较为完整并包含性染色体、端粒到端粒的基因组。
与其他橘小实蝇基因组参考版块比拟，新的基因组“舆图”初次已毕从端粒到端粒的竣工口完整遮掩，填补了以往基因组中高度交流的复杂区域留住的空缺。计划团队还进一步贯通中心粒、性染色体等高交流结构区域，挖掘出Y染色体特异性基因和蔼味受体等潜在的绿色防控技巧靶标，为害虫绿色防控技巧的研发与优化提供了高质地参考基因组资源。（记者杨舒）
